- Christoph Wagner, Farbe und Metapher. Die Entstehung einer neuzeitlichen Bildmetaphorik in der vorrömischen Malerei Raphaels, Berlin 1999
- Christoph Wagner, Der beschleunigte Blick. Hann Trier und das prozessuale Bild, Berlin 1999
- Das Bauhaus und die Esoterik: Johannes Itten, Paul Klee, Wassily Kandinsky, hrsg. von Ch. Wagner, Bielefeld 2005
- Esoterik am Bauhaus: Eine Revision der Moderne?, hrsg. von Christoph Wagner, Regensburg 2009
- U. Nortmann und Ch. (Hrsg.), »In Bildern denken? Kognitive Potentiale von Visualisierung in Kunst und Wissenschaft«, Internationales wissenschaftliches Symposium, Alfried-Krupp-Wissenschaftskolleg in Greifswald, München 2010
- J. Steinbrenner, Ch. Wagner, O. Jehle (Hrsg.), FARBEN in Kunst- und Geisteswissenschaften, Regensburg 2011
- U. Hebel / Ch. Wagner (Eds.), Pictorial Cultures and Political Iconographies. Approaches, Perspectives, Case Studies from Europe and America, Berlin 2011
- Die Brücke und der Exotismus: Bilder des Anderen, hrsg. Ch. Wagner / R. Melcher, Berlin Berlin, 2011
- Ch. Wagner und O. Jehle (Hrsg.), Albrecht Altdorfer. Kunst als zweite Natur, Regensburg 2012
- Ch. Wagner (Hrsg.), Die Befreiungshalle Kelheim. Geschichte, Mythos, Gegenwart, Regensburg 2012
- Itten – Klee. Kosmos Farbe, hrsg. von Christoph Wagner u.a., Regensburg 2012
- Ch. Wagner u.a. (Hg.), »Aisthesis«. Wahrnehmungsprozesse und Visualisierungsformen in Kunst und Technik, Regensburg 2013
- Christoph Wagner (Hg.), Georg Jakob Best. Klee-Schüler, »Entarteter Künstler«, Maler des Informel, Regensburg 2015
- F. Billeter / Ch. Wagner (Hrsg.), Neue Wege zu Hans Purrmann, Berlin 2016
- Christoph Wagner, Johannes Itten. Werkverzeichnis, Band I. Gemälde, Aquarelle, Zeichnungen. 1907–1938, München 2018
- R. Rehm und Ch. Wagner (Hrsg.), Designpatente der Moderne. 1840-1970, Berlin 2019